Servizi per la ricerca su COVID-19
Laniakea: è un servizio cloud che offre la possibilità ai ricercatori di generare e utilizzare istanze Galaxy private per analizzare in autonomia i propri dati. Gli utenti possono creare una propria versione personalizzata di Covid-Galaxy e utilizzare gli strumenti bioinformatici disponibili per l’analisi delle sequenze del genoma virale e della sua evoluzione in un ambiente di lavoro di cui hanno il completo controllo. Questa la pagina per richiedere l’accesso al sistema.
ELIXIR-IT HPC@CINECA: è un servizio High Performance Computing (HPC) che ELIXIR-IT offre ai ricercatori italiani ed europei. Il servizio comprende l’accesso ai cluster HPC del Cineca attraverso un’interfaccia a linea di comando in un ambiente di lavoro preconfigurato con decine di software bioinformatici e dati di riferimento. Per accedere al servizio è necessario compilare questo form di richiesta. Le applicazioni vengono di soliti valutate entro 7gg lavorativi.
CorGAT: CorGAT è un sistema di analisi delle sequenze genomiche che facilita il confronto tra genomi virali e la relativa annotazione. Lo strumento è disponibile sia come software “stand-alone” che attraverso una interfaccia web dedicata. Le annotazioni fornite da CorGAT sono curate manualmente e vengono regolarmente aggiornate dagli sviluppatori. Un manuale completo e dettagliato manuale che ne descrive l’utilizzo di CorGAT è disponibile su readthedocs.