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Prevalenza varianti SARS-CoV-2 in Italia (Rapporto ISS n. 25 e Indagine Rapida ISS del 4 Ottobre 2022)

Prevalenza in Italia delle varianti di interesse epidemiologico di SARS-CoV-2. Dati tratti dal venticinquesimo Rapporto ISS sulla sorveglianza genomica e dall’Indagine Rapida ISS del 4 Ottobre 2022

Pubblicato: 02 December 2022

A partire da Aprile 2021, mese di attivazione della piattaforma integrata per la sorveglianza genomica delle varianti di SARS-CoV-2 (I-Co-Gen), l’Istituto Superiore di Sanità (ISS) con il supporto della Fondazione Bruno Kessler e in collaborazione con il Ministero della Salute, le Regioni e le Province Autonome (PPAA), coordina indagini periodiche per il controllo della diffusione delle varianti di SARS-CoV-2 di potenziale interesse epidemiologico sul territorio nazionale. I risultati di tali indagini vengono rilasciati periodicamente sotto forma di report (maggiori informazioni qui).
La tabella allegata riassume i risultati presentati nel report più recente (dati genomici del 4 Ottobre 2022). Per facilitare il confronto e l’identificazione di varianti la cui prevalenza è aumentata o diminuita, sono riportati i dati del report immediatamente precedente (dati genomici del 6 Settembre 2022).
Prevalenza varianti SARS-CoV-2 in Italia (Rapporto ISS n. 25 e Indagine Rapida ISS del 4 Ottobre 2022)
La tabella riporta la prevalenza percentuale rilevata per la variante Omicron (B.1.1.529, lignaggi derivati BA.n e lignaggi ricombinanti) di SARS-CoV-2 che, alla luce della sua rilevanza epidemiologica, è stata classificata come Variant of Concern o VOC dall’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS). Maggiori informazioni riguardanti il sistema di nomenclatura adottato dall’OMS, possono essere trovate qui.
I dati sulla prevalenza sono aggregati per Regione/Provincia Autonoma ed affiancati dal numero totale di sequenze virali incluse nell’analisi. Sono riportati anche i dati relativi all’intero territorio italiano.
La tabella riporta sia i risultati relativi al report ISS più recente (dati genomici del 4 Ottobre 2022) sia quelli relativi al report immediatamente precedente (dati genomici del 6 Settembre 2022).

In base ai dati raccolti nel corso dell’indagine rapida condotta da ISS il 4 Ottobre 2022, la variante Omicron (lignaggio B.1.1.529, lignaggi derivati BA.n e lignaggi ricombinanti) si conferma l’unica variante di SARS-CoV-2 circolante in Italia con una prevalenza stimata a livello Nazionale del 100,0%.
Tra i sottolignaggi di Omicron, BA.5 continua ad essere predominante. La sua prevalenza, infatti, è pari al 93,01% sul territorio Italiano con valori superiori al 75,0% in ognuna delle Regioni/PPAA analizzate.
Si osserva inoltre un incremento contenuto della prevalenza di BA.2 la quale è passata dall’1,11% dell’indagine precedente (dati del 6 Settembre 2022) al 2,33% dell’aggiornamento più recente (dati del 4 Ottobre 2022). In particolare si evidenzia un aumento nel numero di sequenze attribuibili al lignaggio BA.2.75 (e relativi sottolignaggi) oggetto di monitoraggio a livello Internazionale a causa della presenza di mutazioni che ne potrebbero aumentare l’affinità per il recettore ACE2 e la capacità di eludere la risposta immunitaria in persone vaccinate o precedentemente infettate dal virus [1,2].
Infine, non si registra alcuna variazione significativa nella prevalenza del lignaggio BA.4, pari al 4,27%.

Per approfondire i dati analizzati, le metodiche applicate e le limitazioni dell’indagine qui brevemente presentata è possibile consultare il bollettino completo e la corrispondente analisi sulla prevalenza, entrambi disponibili pubblicamente sul sito web di ISS. I documenti relativi all’ultimo report rilasciato sono disponibili ai seguenti link:

I documenti relativi al report precedente, invece, possono essere trovati ai link sotto riportati:

Fonti:
ISS (dati sulla prevalenza),
[1] “Omicron sublineage BA.2.75.2 exhibits extensive escape from neutralising antibodies”. Daniel J. Sheward et al. November 2022,
[2] “Antigenic characterization of the SARS-CoV-2 Omicron subvariant BA.2.75”. QianWang et al. 9 November 2022