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Genomi virali per regione

Genomi SARS-CoV-2 nella banca dati GISAID per 1000 casi di COVID-19 per regione italiana

Pubblicato: 09 February 2021

La figura rappresenta il numero di genomi di SARS-CoV-2 per ogni 1000 casi di COVID-19 attualmente disponibili nella banca dati GISAID, divisi per regione. Questo è un parametro fondamentale per definire la nostra capacità di identificare rapidamente nuove mutazioni o varianti del virus e monitorare la sua circolazione su base geografica e temporale. Il pannello A mostra la situazione globale. Il pannello B la situazione dell’ultimo mese (dal 6/01/2021 al 5/02/2021).
Genomi virali per regione
Il numero di genomi per migliaia di casi è rappresentato sull’asse X. I dati sono ordinati in ordine decrescente, dalla regione con il più alto numero di genomi a quella con il valore più basso. Il numero di genomi sequenziati per 1000 casi di COVID-19 è rappresentato dalle barre. Il testo in rosso indica i valori rappresentati nel grafico. Il pannello A) riporta il numero totale, mentre il pannello B) il numero di genomi disponibili in banche dati pubbliche sequenziati nell’ultimo mese (dal 6/01/2021 al 5/02/2021).

Questo grafico ci fornisce una panoramica del numero di genomi di SARS-CoV-2 disponibili nella banca dati GISAID per il nostro Paese. Sequenziare una proporzione adeguata di genomi del virus, e rendere i dati disponibili in maniera rapida ed efficiente sono dei requisiti fondamentali per garantire la possibilità di identificare nuove varianti o nuove mutazioni del virus nel minor tempo possibile.

E’ importante sottolineare come allo stato attuale i dati che otteniamo da diverse regioni del nostro Paese sono disomogenei, e non sono sempre aggiornati. Questo significa che ad oggi non è possibile ottenere una panoramica completa ed accurata delle varianti che circolano nel nostro paese, specialmente per alcune regioni.

Tramite un confronto periodico dei dati depositati dalle diverse regioni è possibile ottenere una panoramica sulla completezza e sull’accuratezza delle informazioni disponibili attualmente e sulle possibili criticità. Oltre ad offrire un’istantanea del numero di genomi di SARS-CoV-2 disponibili, questo rapporto mensile ha lo scopo di monitorare l’efficacia delle azioni intraprese dal Italian COVID-19 Data Portal per rendere i dati disponibili più omogenei e completi, e quindi più utili.

Fonte: https://www.gisaid.org/ (per i dati genomici)