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Lo scorso 26 Novembre l’Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS) ha inserito una nuova variante del virus SARS-CoV-2, recentemente identificata in Sudafrica, nella lista delle Variants of Concern (VOCs). La nuova variante è stata denominata Omicron e, secondo la nomenclatura più dettagliata utilizzata a fini scientifici, corrisponde al lignaggio B.1.1.529. La decisione dell’ente è giunta in seguito ad un’attenta analisi del Technical Advisory Group on Virus Evolution (TAG-VE), un gruppo indipendente di esperti che periodicamente monitorano l’evoluzione di SARS-CoV-2. Gli esperti sono giunti a questa decisione poiché hanno constatato che le mutazioni identificate nel genoma di Omicron potessero potenzialmente alterarne il comportamento in maniera significativa (per esempio modificandone la capacità di diffusione o la gravità della malattia da esso causata).
Il presente aggiornamento si concentra sulla descrizione delle caratteristiche desunte, in base ai dati ad oggi disponibili, della variante Omicron.

Da quasi due anni la pandemia da COVID-19 influenza la vita di miliardi di persone e rappresenta una delle maggiori sfide che la comunità scientifica mondiale abbia dovuto affrontare. É dunque fondamentale riflettere sulle modalità con cui la comunità scientifica ha inizialmente risposto all’emergenza in modo da individuare le criticità tecniche ed organizzative che hanno impedito ai ricercatori di tutto il mondo di studiare SARS-CoV-2 fin dalle primissime fasi della pandemia.
Queste sono le premesse che hanno portato al lancio del progetto BeYond-COVID (BY-COVID), un progetto finanziato da Horizon Europe e sotto la direzione scientifica di ELIXIR, il cui obiettivo è quello di affrontare le sfide poste dalla gestione dell’enorme mole di dati prodotti dalla ricerca su SARS-CoV-2 e COVID-19 in modo da sviluppare risorse, modelli condivisi per la gestione dei dati e linee guida che possano essere applicate non solo alla situazione corrente, ma anche a nuove minacce emergenti.

GEN-COVID, un consorzio coordinato dalla Prof.ssa Alessandra Renieri (Università di Siena) e che vede il coinvolgimento di numerose realtà ospedaliere e specialistiche italiane, si prefigge l’ambizioso obiettivo di identificare i determinanti genetici associati al diverso grado di severità della manifestazione clinica del COVID-19. Ad oggi, il consorzio ha permesso la raccolta dei campioni biologici, dati clinici ed il sequenziamento del genoma di più di 3000 pazienti italiani affetti da COVID-19. Il progetto si inserisce all’interno dell’iniziativa mondiale COVID-19 Host Genetic Initiative.

A partire da Aprile 2021, mese di attivazione della piattaforma integrata per la sorveglianza genomica delle varianti di SARS-CoV-2 (I-Co-Gen), l’Istituto Superiore di Sanità (ISS) con il supporto della Fondazione Bruno Kessler e in collaborazione con il Ministero della Salute, le Regioni e le Province Autonome (PPAA), ha avviato e coordina un’indagine volta al controllo della diffusione delle varianti di SARS-CoV-2 di potenziale interesse epidemiologico sul territorio italiano. I risultati di tale indagine vengono rilasciati periodicamente sotto forma di report (maggiori dettagli qui).
Per facilitare il confronto e l’identificazione di varianti che possono aver aumentato/diminuito la propria prevalenza, la tabella allegata offre una panoramica dei risultati presentati nel report più recente (dati genomici relativi al 28 Settembre 2021) e di quelli contenuti nel report immediatamente precedente (dati genomici relativi al 24 Agosto 2021).

Con l’aggiornamento del 3 Settembre scorso, lo European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), la massima autorità sanitaria dell’Unione Europea, ha rimosso la variante Alpha (composta dal lineage B.1.1.7 e dai lineage derivati Q.*) dalla lista delle Variants of Concern (VOC) e l’ha inserita in quella delle De-escalated Variants. Il presente aggiornamento si pone come obiettivo quello di illustrare brevemente le ragioni di tale decisione da parte dell’ente.

A partire da Aprile 2021, mese di attivazione della piattaforma integrata per la sorveglianza genomica delle varianti di SARS-CoV-2 (I-Co-Gen), l’Istituto Superiore di Sanità (ISS) con il supporto della Fondazione Bruno Kessler e in collaborazione con il Ministero della Salute, le Regioni e le Province Autonome (PPAA), ha avviato e coordina un’indagine volta alla mappatura della diffusione delle varianti di SARS-CoV-2 di potenziale interesse epidemiologico sul territorio italiano. I risultati di tale indagine vengono rilasciati periodicamente sotto forma di report (maggiori dettagli qui).
Per facilitare il confronto e l’identificazione di varianti che possono aver aumentato/diminuito la propria prevalenza, la tabella allegata offre una panoramica dei risultati presentati nel report più recentemente rilasciato (dati genomici relativi al 24 Agosto 2021) e di quelli ottenuti nel report immediatamente precedente (dati genomici relativi al 20 Luglio 2021).